Biologie Moléculaire

Au niveau national

Les examens de biologie moléculaire sont aujourd’hui incontournables en cancérologie. En orientant vers une prise en charge des patients de plus en plus personnalisée, ils représentent un atout majeur pour le diagnostic, le pronostic, la réponse au traitement et le suivi de la pathologie tumorale.

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Les tests moléculaires visent à détecter des anomalies ou des altérations moléculaires au sein d’un prélèvement tumoral des patients. Ces tests sont prescrits par un oncologue, un spécialiste d’organe ou un pathologiste.
Ces analyses, ayant pour objectif de mieux caractérisé la pathologie, permettent d’adapter et d’améliorer la prise en charge :

  • Fiabiliser le diagnostic (permet de compléter l'examen anatomo-pathologique de la tumeur par exemple en oncohématologie, sarcomes, certaines tumeurs cérébrales,...)
  • Etayer le pronostic,
  • Envisager une prise en charge thérapeutique ciblée,
  • Assurer le suivi des patients à long terme (orientation en oncogénétique, suivi de maladie résiduelle, avancées thérapeutiques).

Ces examens sont principalement réalisés par les plateformes de biologie de moléculaire, où les analyses moléculaires se font en collaboration entre les laboratoires d'anatomo-pathologie et les laboratoires de biologie médicale.

Avec l’arrivée du Séquençage Nouvelle Génération (NGS), le domaine de la génétique moléculaire évolue et grâce aux  analyses à haut débit et à grande échelle, va notamment permettre d’obtenir un profil moléculaire de la tumeur.

Pour en savoir plus :

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Les tests ou marqueurs déterminant l'accès à des thérapies ciblées - INCA

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Listes de gènes minimales à analyser dans le cadre d'un usage à visée diagnostique du NGS (février 2016)

Afin de « conforter l’avance de la France dans la médecine personnalisée » (Objectif 6  du Plan Cancer 2014-2019) en particulier de « conforter l’accès aux tests moléculaires » (Action 6.2), l’Institut National du Cancer a soutenu les  28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers. Ces plateformes, réparties sur tout le territoire, assure une équité d’accès aux tests moléculaires pour tous les patients et ce quel que soit leur établissement de prise en charge.
Pour pouvoir suivre les évolutions technologiques et être en mesure de réaliser l’ensemble des tests nécessaires pour le diagnostic et la prise en charge thérapeutique des patients atteints de certaines tumeurs solides ou hématologiques,  elles regroupent plusieurs laboratoires et reposent sur les compétences de pathologistes et de
biologistes.

L’organisation d’un maillage territorial entre les laboratoires d'anatomopathologie et une plateforme est un élément clé pour une prise en charge rapide des prélèvements tumoraux.

Pour en savoir plus :

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Les plateformes de génétique moléculaire des cancers - INCA

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Annuaire des plateformes de génétique moléculaire - INCA 2017

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Les données d’activité des plateformes

Dans le cadre du développement de l’innovation en santé et afin de soutenir la biologie médicale et à l’anatomopathologie, la direction générale de l’offre de soins (DGOS) a mis en place un dispositif de financement des actes innovants de biologie médicale et d’anatomopathologie : 2 référentiels des actes hors nomenclature

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Le référentiel des actes innovants hors nomenclature (RIHN)

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La liste complémentaire d’actes (LC)

L’instruction du 16 avril 2018 précise la règle applicable dans le cas où l’acte est prescrit et réalisé dans des établissements de santé distincts. Dans ce cas de figure, l’établissement effecteur peut facturer l’acte à l’établissement prescripteur. L’établissement prescripteur peut demander un financement de cette activité au titre de la MERRI G03. L’acte ne doit aucunement être facturé au patient.
Pour cela, il doit déclarer les différents actes à l’aide du logiciel dédié FICHSUP. Le remboursement s’effectue l’année suivante.

Pour en savoir plus :

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Référentiel des actes innovants hors nomenclature de biologie et d’anatomopathologie (RIHN)

Le programme AcSé (Accès sécurisé aux thérapies ciblées), développé en accord avec l’Agence nationale de sécurité du médicament et des produits de santé (ANSM), permet de proposer aux patients susceptibles d’en bénéficier un accès précoce aux médicaments innovants sur l’ensemble du territoire et de façon sécurisée, grâce à leur participation à un essai clinique.

Ainsi, l’objectif de ce programme est de proposer aux patients atteints de cancers et en situation d’échec thérapeutique, des thérapies ciblant les mutations génétiques présentes dans leur tumeur, solide ou hématologique, indépendamment de l’organe concerné. Les anomalies génétiques identifiées dans le cancer d’un organe donné peuvent, en effet, être présentes dans des cancers d’autres organes, pour lesquels le développement thérapeutique n’a pas été effectué et l’autorisation de mise sur le marché (AMM) n’a pas été demandée.

Pour en savoir plus :

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Le programme AcSé - INCA

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Article de l'INCA dans le Nature Reviews Clinical Oncology "Egalité d'accès aux thérapies innovantes"

 

Au niveau régional

Afin d’offrir à l’ensemble des patients de la région Occitanie, quel que soit l’établissement où ils sont pris en charge, un accès égal aux tests moléculaires et permettre d’engager une prise en charge personnalisée, un maillage territorial entre les plateformes de génétique moléculaire des cancers et les laboratoires d’anatomopathologie a été mis en place.

L'ensemble des tests moléculaires indispensables pour la prise en charge des patients atteints d’un cancer est effectué par les plateformes régionales de génétique moléculaire des cancers et les plateformes privées de biopathologie de la région Occitanie.

Ces plateformes sont constituées de plusieurs laboratoires répartis sur plusieurs sites :
 

Plateforme de génétique moléculaire de Montpellier – Nîmes

  • Plateforme Hospitalo-Universitaire de Biopathologie du CHU et de l’ICM de Montpellier
    • CHU Montpellier
      • Département de biopathologie cellulaire et tissulaire des tumeurs
        • Hôpital Gui de Chauliac - Laboratoire d’anatomie cytologie pathologiques - Pr V.Rigau - Contact : Tél. : 04 67 33 72 83
        • Hôpital Arnaud de Villeneuve - Laboratoire de biologie cellulaire et tumorale - Pr T.Maudelonde / Pr J.Solassol / Dr C.Goze - Contact : Tél. : 04 67 33 58 77 - Email : bio-cel-sec@chu-montpellier.fr
        • Hôpital Saint Eloi - Laboratoire de Génétique des Hémopathies Malignes - Contact : Tel. 04 67 33 70 31 - Email : labo-hemato@chu-montpellier.fr
    • Institut régional du cancer de Montpellier (ICM)
      • Département de biopathologie
        • ICM - Laboratoire d’anatomie cytologie pathologiques – Dr A. Maran-Gonzalez - Contact : Tél. : 04.67.61.31.21- Email : Biopathologie@icm.unicancer.fr
        • CHU Montpellier - Laboratoire de biologie spécialisée et oncogénétique Pr J.Solassol - Contact : Tél. : 04 67 33 58 77 - Email : bio-cel-sec@chu-montpellier.fr
  • CHU Nîmes Hôpital Caremeau - Place du Professeur Robert DEBRE - 30029 Nimes Cedex 9
    • Laboratoire d’anatomie cytologie pathologiques - Pr P.Roger / Dr S.Gonzalez / Dr J.M Joujoux / Dr J. Hazebroucq / Dr M.L Gaume - Contact : 04 66 68 82 74
    • Laboratoire de biochimie et biologie moléculaire Pr S.Lumbroso / Dr J.C Boyer/ Dr J.P.Broulliet / Dr A.Evrard - Contact : 04 66 68 41 60
    • Laboratoire de cytologie clinique et de cytogénétique - Pr T.Lavabre-Bertrand / Dr J.Chiesa / Dr S. Carillo - Contact : 04 66 68 32 07

Imagenome Biopathologie - Génétique des cancers - Montpellier

Imagenome Biopathologie – Dr PJ. Lamy
6 rue Fontenille 34000 Montpellier
Contact : Tel. : 04 30 05 31 00 / Fax : 04 30 05 31 01
Email : imagenome@labosud.fr

MEDIPATH - Plateforme moléculaire - Montpellier

80 rue Pythagore 34170 Castelnau-le-Lez
Contact : Tel. 04 99 23 32 60
Email : biopathologie@medipath.fr

Plateforme de génétique moléculaire de Toulouse :

Institut Universitaire du Cancer de Toulouse Oncopole, 1 Avenue Irène Joliot Curie 31059 Toulouse cedex 9

  • Département d’Anatomie Pathologiques - Pr P. Brousset / Pr L. Lamant / Pr J. Selves / Dr S. Evrard - Contact : Tél. : 05 31 15 63 66 - 05 31 15 63 74 / Fax : 05 31 15 65 92 - Email : plateformemoleculaire@iuct-oncopole.fr
  • Laboratoire de biologie médicale Oncologique - Pr G.Favre - Contact : Tél. : 05 31 15 52 42 / Fax : 05 31 15 52 38
  • Laboratoire des hémopathies malignes– Pr E.Delabesse - Contact : Tél. : 05 31 15 62 24
  • Unité génomique du myélome - Pr H.Avet-Loiseau / Dr J.Corre - Contact : Tel. 05 31 15 61 42

 

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 Référentiel de biologie moléculaire
Le référentiel de biologie moléculaire recense l'ensemble des examens disponibles sur les plateformes régionales de génétique des cancers. Il est structuré par pathologie et présente les indications thérapeutiques, diagnostiques, pronostiques ainsi que les modalités de réalisation des analyses essentielles à la prise en charge du patient. Il est en cours d’actualisation actuellement.

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 Fiches de prescription

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 Outils pour la pratique

 

Les examens de biologie moléculaire sont réalisés sur prescription médicale.
Actuellement sur la région Occitanie, la prescription peut se faire selon l’organisation de chaque plateforme soit via les fiches dédiées pour les plateformes de Montpellier et de Nîmes soit directement dans le Dossier Communicant de Cancérologie (DCC) pour la plateforme de Toulouse.
Le dispositif de prescription en ligne, mis en place avec la plateforme de Toulouse, permet de prescrire, de suivre l’état d’avancement des analyses moléculaires, et d’intégrer le résultat dans le dossier patient tout en assurant la traçabilité des différentes étapes.

  1. Prescription médicale par l'oncologue, le spécialiste d'organe, le pathologiste (A saisir directement sur le Dossier Communicant de Cancérologie (DCC)
    1. Ajouter une analyse moléculaire
    2. Saisir la demande et la valider
    3. Générer le formulaire de demande avec code barre  
    4. Envoyer ce formulaire via messagerie sécurisée (Medimail) ou imprimer ce formulaire et l'envoyer par courrier ou par fax  au pathologiste détenteur du matériel tumoral
  2. Conditionnement et transfert du matériel tumoral par le pathologiste
    1. Compléter la demande (avec code barre)
    2. Envoyer cette même demande complétée accompagnée du matériel tumoral à la plateforme régionale de pathologie moléculaire
  3. Analyse par la plateforme de pathologie moléculaire
    1. Réception de la demande et du matériel
    2. Analyse et enregistrement du résultat en temps réel sur le DCC

L’extension de cette prescription en ligne est en cours d’étude actuellement.

 

Des réunions de concertation pluridisciplinaire (RCP) moléculaires se mettent en place progressivement en région afin de réunir les spécialistes impliqués dans la prise en charge des patients potentiellement éligibles pour des essais thérapeutiques et ainsi prendre une décision thérapeutique avec l’ensemble des données cliniques, biologiques et génétiques à disposition.

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 Consulter l'annuaire des RCP de recours

 

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Biologie moléculaire